MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 35285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008022	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	94989510
2	NC_008022	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	94989510
3	NC_008022	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989510
4	NC_008022	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	94989510
5	NC_008022	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989510
6	NC_008022	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989510
7	NC_008022	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989510
8	NC_008022	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989510
9	NC_008022	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989510
10	NC_008022	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	94989510
11	NC_008022	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989510
12	NC_008022	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	94989510
13	NC_008022	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989510
14	NC_008022	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	94989510
15	NC_008022	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	94989510
16	NC_008022	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989510
17	NC_008022	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	94989510
18	NC_008022	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989510
19	NC_008022	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989510
20	NC_008022	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94989510
21	NC_008022	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	94989510
22	NC_008022	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989510
23	NC_008022	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989510
24	NC_008022	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989510
25	NC_008022	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94989510
26	NC_008022	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989510
27	NC_008022	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	94989510
28	NC_008022	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
29	NC_008022	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989511
30	NC_008022	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	94989511
31	NC_008022	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
32	NC_008022	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	94989511
33	NC_008022	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
34	NC_008022	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989511
35	NC_008022	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989511
36	NC_008022	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989511
37	NC_008022	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
38	NC_008022	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
39	NC_008022	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989511
40	NC_008022	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	94989511
41	NC_008022	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989511
42	NC_008022	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	94989511
43	NC_008022	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989511
44	NC_008022	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989511
45	NC_008022	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989511
46	NC_008022	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989511
47	NC_008022	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989511
48	NC_008022	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94989511
49	NC_008022	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	94989511
50	NC_008022	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989511
51	NC_008022	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	94989511
52	NC_008022	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	94989511
53	NC_008022	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94989512
54	NC_008022	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	94989512
55	NC_008022	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989512
56	NC_008022	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	94989512
57	NC_008022	CAG	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989513
58	NC_008022	GCT	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989513
59	NC_008022	TGGTA	2	10	3571	3580	20 %	40 %	40 %	0 %	94989513
60	NC_008022	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	94989513
61	NC_008022	AAAT	2	8	3709	3716	75 %	25 %	0 %	0 %	94989513
62	NC_008022	TGA	3	9	3769	3777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989513
63	NC_008022	TCAA	2	8	3875	3882	50 %	25 %	0 %	25 %	94989513
64	NC_008022	A	6	6	3903	3908	100 %	0 %	0 %	0 %	94989513
65	NC_008022	AGA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
66	NC_008022	GTT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989513
67	NC_008022	AAC	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989513
68	NC_008022	CAAA	2	8	4129	4136	75 %	0 %	0 %	25 %	94989513
69	NC_008022	AGT	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989513
70	NC_008022	AGA	3	9	4192	4200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
71	NC_008022	AGA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
72	NC_008022	AGC	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989513
73	NC_008022	ATC	2	6	4293	4298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989513
74	NC_008022	CAG	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989513
75	NC_008022	GCT	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989513
76	NC_008022	TAT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989513
77	NC_008022	ATG	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989513
78	NC_008022	AAG	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
79	NC_008022	GAA	2	6	4502	4507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989513
80	NC_008022	TGT	2	6	4519	4524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989513
81	NC_008022	CAT	2	6	4537	4542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989513
82	NC_008022	GAA	2	6	4592	4597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989514
83	NC_008022	TTG	2	6	4647	4652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989514
84	NC_008022	A	6	6	4680	4685	100 %	0 %	0 %	0 %	94989514
85	NC_008022	GAT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989514
86	NC_008022	TTA	2	6	4788	4793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989514
87	NC_008022	CTA	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989514
88	NC_008022	AAT	2	6	4835	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989514
89	NC_008022	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989514
90	NC_008022	ATG	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989514
91	NC_008022	TTACGT	2	12	4937	4948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94989514
92	NC_008022	CAG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989514
93	NC_008022	GAC	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989514
94	NC_008022	TTA	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989514
95	NC_008022	ATA	2	6	5100	5105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989514
96	NC_008022	TTTA	2	8	5151	5158	25 %	75 %	0 %	0 %	94989514
97	NC_008022	A	6	6	5175	5180	100 %	0 %	0 %	0 %	94989514
98	NC_008022	ATT	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
99	NC_008022	ACC	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94989515
100	NC_008022	GAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
101	NC_008022	A	9	9	5348	5356	100 %	0 %	0 %	0 %	94989515
102	NC_008022	TGA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
103	NC_008022	T	6	6	5443	5448	0 %	100 %	0 %	0 %	94989515
104	NC_008022	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
105	NC_008022	TTA	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
106	NC_008022	T	6	6	5788	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	94989515
107	NC_008022	GAT	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
108	NC_008022	AAC	2	6	5849	5854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
109	NC_008022	TTA	2	6	5867	5872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
110	NC_008022	GAT	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
111	NC_008022	A	6	6	5962	5967	100 %	0 %	0 %	0 %	94989515
112	NC_008022	AGA	2	6	5976	5981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
113	NC_008022	A	6	6	5997	6002	100 %	0 %	0 %	0 %	94989515
114	NC_008022	ATT	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
115	NC_008022	ATT	2	6	6063	6068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989515
116	NC_008022	T	6	6	6097	6102	0 %	100 %	0 %	0 %	94989515
117	NC_008022	GAT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
118	NC_008022	GATTT	2	10	6137	6146	20 %	60 %	20 %	0 %	94989515
119	NC_008022	AGA	2	6	6168	6173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
120	NC_008022	ACT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989515
121	NC_008022	CTT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989515
122	NC_008022	T	6	6	6337	6342	0 %	100 %	0 %	0 %	94989515
123	NC_008022	TTGA	2	8	6358	6365	25 %	50 %	25 %	0 %	94989515
124	NC_008022	A	7	7	6383	6389	100 %	0 %	0 %	0 %	94989515
125	NC_008022	AAC	2	6	6393	6398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
126	NC_008022	ACGA	2	8	6431	6438	50 %	0 %	25 %	25 %	94989515
127	NC_008022	CCTT	2	8	6471	6478	0 %	50 %	0 %	50 %	94989515
128	NC_008022	AGTG	2	8	6480	6487	25 %	25 %	50 %	0 %	94989515
129	NC_008022	TGA	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
130	NC_008022	ACG	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989515
131	NC_008022	GATTCA	2	12	6732	6743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94989515
132	NC_008022	CTG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989515
133	NC_008022	CAA	2	6	6864	6869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989515
134	NC_008022	TGA	2	6	6933	6938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
135	NC_008022	AAG	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989515
136	NC_008022	ATTTTC	2	12	6978	6989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94989515
137	NC_008022	GAT	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989515
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271	NC_008022	GTA	2	6	12405	12410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989521
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